近年来，涟水县以医保付费方式改革为抓手，建立完善总额控制下按病种分值结算为主，日间手术、人头付费、按项目付费等多元复合式医保付费体系，实现医保基金收支平衡，形成了医、保、患三方共赢的良好局面。
一是调整完善医保结算政策。出台《关于做好2020年度基本医疗保险定点医疗机构住院费用结算工作的通知》，精细化测算职工医保、居民医保基金支出情况，确定职工 居民医保年度统筹基金支出的结构和比例，完善可分配资金确定；及时执行《2020版淮安市基本医疗保险病种分值》，调整原有病种不合理分值；三是全县不同等级定点医疗机构病种分值结算系数由2019年度医保基金支付实际情况确定，且职工、居民医保病种分值结算等级系数相同。
二是扩大病种分值结算范围。市内一、二、三级医疗机构全部实行“总额控制、分月预付、年终决算”的办法，按病种分值结算的定点医疗机构由县内43家医院扩大到全市所有与我县发生医疗费用的机构，基金结算费用涵盖职工医保（含生育保险）、居民医保基金。
三是深化药品、医用耗材集中带量采购制度改革。全面实行药品、医用耗材集中带量采购。组织全县35家医疗机构参加第二批国家32种药品集中采购，按要求在3月中旬完成各医疗机构采购数量分配，形成采购量明细清单，4月份，定点医疗机构与供应商签订采购合同，组织县人民医院、中医院、三院3家二级以上医疗机构参加淮安、南京、泰州三地耗材联盟首轮耗材带量采购工作，采购总金额112.4万元。
四是预付医保基金，提高医疗机构资金周转率。第二批国家32种药品集中采购中，医保部门直接支付30%的预付金19.41万元；第三批国家药品集中采购，直接支付预付金131.82万元。